بعد سقوط النظام المباد تأسست عدداً من الجامعات للدراسات الأولية وهي: 1ـ الكلية الإسلامية الجامعة وتقع في ساحة الميدان عند مدخل مدينة النجف القديمة وتأسست سنة (2003م) وحصلت على الاعتراف الرسمي بالتأسيس من وزارة التعليم العالي والبحث العلمي في 19/ 8/ 2004، وتضم الأقسام التالية:أـ هندسة تقنيات الحاسبات ويضم (607) طالب و طالبة. ب ـ العلوم السياسية والدولية و يضم (116) طالب وطالبة. ج ـ الفكر الإسلامي والعقيدة و يضم (230) طالب و طالبة.د ـ الصحافة ويضم (24) طالب و طالبة. هـ ـ القانون ويضم (489) طالب وطالبة. و ـ الدراسات القرآنية واللغوية ويضم (216) طالب و طالبة. ويذكر أن عدد الطلبة المنتمين للمؤسسة المتقدمة منذ تأسيسها ولحد الآن بلغ (1.800) طالب وطالبة، تخرج منها (98) في العام الدراسي (2007ــ2008م). 2ـ كلية الشيخ الطوسي وتقع قرب دائرة بريد النجف، تأسست سنة (2004م) وتضم أقسام القرآن الكريم، وأصول الدين، والتبليغ الإسلامي. 3ـ كلية الدراسات الإنسانية الجامعة في حي الأمير، تأسست سنة (2005م) وتضم أقسام الشريعة الإسلامية، أصول الدين، القانون، وهندسة تقنية الحاسبات. 4ـ جامعة الإمام الصادق عليه السلام في حي السعد، تأسست سنة (2005م) وتضم كليتي تكنولوجيا المعلومات، والقانون والسياسة. 5ـ معهد العلمين للدراسات العليا ويمنح الشهادات العليا في الدراسات السياسية، والدراسات الدولية.